More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3930 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3930  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 412 aa  832    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.51 
 
 		 367 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  30.34 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 384 aa  87  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 367 aa  86.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.73 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  32.14 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  29.02 
 
 		 745 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.52 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  19.44 
 
 		 750 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  21.73 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  25.26 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.02 
 
 		 365 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3397  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.25 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  27.17 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.9 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  23.73 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  28 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  25.65 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  25.09 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 1080 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>