More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3442 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 385 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  53.35 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2890  glycosyltransferase-like protein  36.58 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1083  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 384 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 1080 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  24.87 
 
 		 745 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 440 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.92 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  39.43 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.02 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  26.93 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.02 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  31.02 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  31.02 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.02 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  31.02 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  34.71 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.02 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.93 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  34.16 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.06 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 		 453 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.9 
 
 		 822 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  35.56 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  33.17 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.72 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.06 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  34.16 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 765 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0942  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 360 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  27.51 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.06 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.29 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.56 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>