More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2890 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2890  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
389 aa  793    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  36.58 
 
 
385 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1083  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
384 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
374 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
377 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.2 
 
 
427 aa  92.8  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  24.2 
 
 
430 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
372 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.05 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
505 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
384 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.54 
 
 
822 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  26.07 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
468 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.58 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  30.84 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  28.81 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  34.36 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.38 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
503 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.65 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.97 
 
 
346 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>