More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1083 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1083  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 384 aa  792    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2890  glycosyltransferase-like protein  30.16 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.62 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 822 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  33.5 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 819 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 704 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  26.79 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2710  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.395873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  24.75 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.7 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  24.04 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  25.77 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  28.28 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  25.96 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.96 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.07 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.96 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  28.64 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  21.56 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  27.05 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  24.3 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.04 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>