More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0942 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0942  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
386 aa  760    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0775  glycosyl transferase, group 1  53.72 
 
 
390 aa  331  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1244  glycosyl transferase, group 1  51.19 
 
 
380 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3125  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
406 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.63 
 
 
388 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
399 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
382 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
371 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
385 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  34.88 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
374 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
374 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
381 aa  89.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.52 
 
 
373 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
383 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.41 
 
 
745 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  26.01 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.47 
 
 
2401 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  28.99 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.76 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  27.62 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.77 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  27.14 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.3 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.3 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.3 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
704 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  25.11 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  33.59 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  24.9 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.63 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.41 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  23.79 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>