More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5686 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1080 aa  2195    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  68.46 
 
 		 1079 aa  1504    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49 
 
 		 367 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 		 364 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 		 364 aa  269  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 		 364 aa  269  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  47.18 
 
 		 316 aa  255  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2205  oxidoreductase domain protein  45.37 
 
 		 323 aa  228  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  38.89 
 
 		 324 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  38.58 
 
 		 324 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 		 324 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  40.13 
 
 		 323 aa  208  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 354 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 		 372 aa  161  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.52 
 
 		 357 aa  138  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 344 aa  121  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  32.47 
 
 		 371 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  28.39 
 
 		 745 aa  114  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 371 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 		 377 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 395 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 364 aa  111  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 389 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 371 aa  110  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 394 aa  110  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 		 383 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.2 
 
 		 365 aa  110  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 382 aa  108  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 		 387 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 378 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  30.22 
 
 		 369 aa  106  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 353 aa  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 750 aa  103  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  41.96 
 
 		 394 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 389 aa  103  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 		 413 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 379 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 371 aa  100  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 385 aa  99.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 739 aa  100  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 377 aa  100  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 419 aa  99.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 		 386 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 368 aa  99  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 366 aa  99  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 369 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 387 aa  98.2  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  37.21 
 
 		 419 aa  98.2  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 384 aa  98.2  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 375 aa  98.2  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  42.38 
 
 		 371 aa  98.2  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 391 aa  98.2  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.92 
 
 		 396 aa  97.8  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  36.55 
 
 		 383 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 		 439 aa  97.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 385 aa  97.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 383 aa  97.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 381 aa  96.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 398 aa  96.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 		 409 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 399 aa  96.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 		 382 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 		 419 aa  95.9  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 386 aa  95.9  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 409 aa  95.1  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 347 aa  95.1  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 440 aa  94.7  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 370 aa  94.7  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 386 aa  94.7  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.54 
 
 		 365 aa  94  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 387 aa  94.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 395 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 		 370 aa  94  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 		 387 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.18 
 
 		 343 aa  94  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 388 aa  93.2  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 413 aa  93.2  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.66 
 
 		 366 aa  92.8  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 358 aa  92.8  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 381 aa  93.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 377 aa  93.2  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 383 aa  92.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 337 aa  92.4  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 345 aa  92.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 394 aa  92.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 383 aa  92  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 394 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 384 aa  92  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 394 aa  91.7  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 366 aa  91.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 374 aa  91.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 388 aa  91.3  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 305 aa  91.3  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 373 aa  91.3  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 389 aa  91.3  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 412 aa  90.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 387 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 371 aa  90.5  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 389 aa  90.1  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>