More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1013 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  681    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.18 
 
 
335 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  39.4 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  39.04 
 
 
334 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  38.21 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  37.43 
 
 
336 aa  231  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  38.74 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.78 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.46 
 
 
341 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.59 
 
 
349 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.83 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  36.83 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  36.83 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  36.11 
 
 
337 aa  215  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  39.17 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.08 
 
 
329 aa  212  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  35.8 
 
 
338 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  35.87 
 
 
341 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  34.42 
 
 
340 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  40.06 
 
 
326 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  35.42 
 
 
316 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  37.61 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  35.42 
 
 
316 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  37.32 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  37.32 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.32 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  37.32 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  37.32 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  37.32 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  35.45 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  35.54 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  35.15 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  35.61 
 
 
340 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  37.98 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  34.44 
 
 
338 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 
329 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  37.31 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  37.31 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  38.41 
 
 
334 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  37.31 
 
 
345 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  37.31 
 
 
345 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  36.25 
 
 
330 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  37.72 
 
 
328 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 
328 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.95 
 
 
342 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  36.17 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.36 
 
 
334 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  34.55 
 
 
328 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  36.91 
 
 
330 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  35.84 
 
 
339 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  37.36 
 
 
287 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 
366 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 
327 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  35.4 
 
 
342 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  33.64 
 
 
328 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  36.58 
 
 
333 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  34.01 
 
 
366 aa  186  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  35.58 
 
 
334 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.39 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  37.76 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 
349 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  37.46 
 
 
323 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  34.49 
 
 
366 aa  182  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 
361 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.87 
 
 
330 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  32.46 
 
 
365 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.25 
 
 
328 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  36.25 
 
 
328 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  36.25 
 
 
328 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 
332 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  35.89 
 
 
328 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 
331 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.82 
 
 
328 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  35.61 
 
 
330 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  34.6 
 
 
347 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.93 
 
 
335 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 
339 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  32.2 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  35.57 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  36.36 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  36.61 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.91 
 
 
331 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
336 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  37.02 
 
 
329 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  32.75 
 
 
355 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  32.84 
 
 
334 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  32.53 
 
 
330 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  33.14 
 
 
340 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
389 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  32.64 
 
 
355 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 
352 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  35.24 
 
 
325 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  35.74 
 
 
368 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  31.94 
 
 
330 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  33.72 
 
 
342 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>