More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0335 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 323 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  51.13 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  51.13 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  50.8 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  39.94 
 
 		 1080 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  40.88 
 
 		 1079 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2205  oxidoreductase domain protein  52.17 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  44.97 
 
 		 316 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  35.82 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  37.55 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  33.48 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 		 350 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  32.5 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  33.62 
 
 		 352 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  31.17 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  34.02 
 
 		 347 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  27.22 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  32.89 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 		 361 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.49 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.18 
 
 		 353 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  38.33 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  37.39 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  36.52 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.63 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  31.08 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.64 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  23.79 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.36 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.39 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.3 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  32.77 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.64 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  33.61 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  35.56 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.3 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  31.58 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.06 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.06 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.06 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.67 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.01 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.39 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  32.09 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.93 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.66 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.77 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.96 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  27.24 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>