More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3282 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  679    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  62.13 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  61.83 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  61.83 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  62.13 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  62.13 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  61.83 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  60.61 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  62.61 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  57.56 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  57.64 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  45.4 
 
 		 355 aa  279  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  42.31 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  41.06 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  38.97 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1451  oxidoreductase family protein  64.08 
 
 		 580 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  38.9 
 
 		 366 aa  255  8e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  37.71 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  38.33 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  37.43 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  38.81 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  37.61 
 
 		 337 aa  232  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.61 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.04 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  34.51 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.4 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  30.68 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  33.54 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  32.24 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  33.93 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  32.3 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  35.89 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  29.85 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  36.75 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.11 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  34.23 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  34.71 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.06 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  35.91 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  36.72 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  31.06 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  31.06 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  34.53 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  30.38 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  35.63 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 		 389 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  32.63 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  34.63 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  32.06 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  33.94 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  33.24 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  31.4 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.31 
 
 		 347 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  31.65 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  32.44 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.63 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.53 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  33.04 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  33.04 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  31.66 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  33.04 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  33.04 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  33.98 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.98 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  33.98 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  33.24 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.16 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  34.55 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.9 
 
 		 342 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  32.25 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  34.23 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.63 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  32 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  34.62 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  30.12 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  32.1 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  29.82 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.33 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.66 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  31.83 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.06 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  33.02 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.02 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>