More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3968 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
342 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  86.55 
 
 
338 aa  597  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  57.19 
 
 
333 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  57.27 
 
 
347 aa  355  8.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  48.81 
 
 
340 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  48.97 
 
 
338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  45.27 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  44.97 
 
 
330 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 
341 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  44.78 
 
 
323 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  41.44 
 
 
334 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.5 
 
 
339 aa  256  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  42.56 
 
 
328 aa  248  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  41.09 
 
 
324 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  43.84 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  40.9 
 
 
331 aa  228  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.52 
 
 
329 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  38.46 
 
 
336 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  35.99 
 
 
334 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  37.43 
 
 
334 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 
335 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  36.36 
 
 
339 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  35.21 
 
 
342 aa  205  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 
328 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  37.58 
 
 
327 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  37.7 
 
 
328 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  34.59 
 
 
336 aa  204  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
326 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 
328 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.95 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  35.03 
 
 
328 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  37.38 
 
 
328 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.38 
 
 
328 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 
338 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  37.38 
 
 
328 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.38 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  34.73 
 
 
328 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  35.61 
 
 
331 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  34.43 
 
 
328 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  38.07 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.5 
 
 
334 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 
330 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  34.78 
 
 
341 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  36.25 
 
 
338 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  33.83 
 
 
332 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.09 
 
 
341 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  35.93 
 
 
328 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  35.09 
 
 
341 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  35.09 
 
 
341 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  38.86 
 
 
339 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  37.87 
 
 
389 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  35.12 
 
 
330 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 
328 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  34.51 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  38.55 
 
 
339 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  38.55 
 
 
339 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.55 
 
 
339 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  38.55 
 
 
339 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  38.55 
 
 
339 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  38.55 
 
 
339 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  36 
 
 
344 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  33.54 
 
 
316 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  33.23 
 
 
316 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 
330 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  36.56 
 
 
339 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  38.05 
 
 
342 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  36.22 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 
330 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
329 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  36.72 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  33.13 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  32.66 
 
 
340 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  35.29 
 
 
287 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.34 
 
 
331 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  34.03 
 
 
330 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  32.89 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  30.84 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  31.73 
 
 
317 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  35.01 
 
 
339 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.72 
 
 
337 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  36.64 
 
 
341 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.65 
 
 
350 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  34.42 
 
 
340 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  33.72 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 
366 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.35 
 
 
338 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 
365 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
366 aa  142  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
366 aa  142  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
337 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  35.23 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.48 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  31.86 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  38.74 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>