More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2804 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  95.03 
 
 		 342 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 338 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  92.9 
 
 		 339 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  567  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  567  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  567  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  567  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  567  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  567  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  564  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  85.42 
 
 		 339 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  74.92 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  74.31 
 
 		 328 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  74.31 
 
 		 328 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  73.7 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  74.01 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  74.31 
 
 		 328 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  63.83 
 
 		 331 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  50.76 
 
 		 336 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.38 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  49.24 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.08 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  45.87 
 
 		 328 aa  291  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  45.26 
 
 		 328 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  45.29 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  47.11 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.93 
 
 		 330 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  47.11 
 
 		 330 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  43.69 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  45.43 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  43.38 
 
 		 328 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  49.54 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  41.25 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  45.12 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  46.95 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  46.5 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.62 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  42.81 
 
 		 330 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  46.79 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  41.27 
 
 		 334 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.88 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  42.81 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.57 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  42.54 
 
 		 317 aa  255  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  40.57 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  40.57 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  43.75 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  39.94 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  39.52 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  43.07 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  42.59 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  37.65 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  39.58 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  38.92 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  39.76 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  40.24 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  34.63 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  37.54 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  39.92 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  39.45 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  40.48 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  34.05 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  37.58 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  37.83 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  37.58 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  36.78 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  36.47 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  35.86 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  35.87 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  38.27 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  32.93 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  38.26 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  35.49 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  34.25 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  37.61 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  37.72 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  34.65 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.24 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.12 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.5 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.21 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  33.82 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  33.82 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  33.84 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  36.23 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  33.82 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  33.82 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  33.53 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>