More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5295 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
340 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  72.86 
 
 
339 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  56.68 
 
 
338 aa  358  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  55.16 
 
 
340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.23 
 
 
335 aa  335  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  57.05 
 
 
336 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  54.49 
 
 
352 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  53.77 
 
 
368 aa  299  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1848  Inositol 2-dehydrogenase  55.99 
 
 
340 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0363596  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  38.24 
 
 
335 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  35.74 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  36.25 
 
 
326 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
334 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  36.67 
 
 
329 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  32.64 
 
 
342 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.5 
 
 
335 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  31.66 
 
 
336 aa  175  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.35 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  36.18 
 
 
330 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.2 
 
 
334 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  37.13 
 
 
389 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 
336 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  33.02 
 
 
316 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.33 
 
 
329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  32.72 
 
 
316 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 
330 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  36.28 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  35.61 
 
 
330 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.05 
 
 
353 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
337 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.89 
 
 
341 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  32.57 
 
 
341 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  34.93 
 
 
328 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
332 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.78 
 
 
341 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 
328 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 
328 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 
328 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  32.89 
 
 
341 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  32.89 
 
 
341 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 
329 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
328 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
349 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  33.66 
 
 
347 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  37.87 
 
 
334 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 
330 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 
328 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
331 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  32.84 
 
 
334 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.62 
 
 
350 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.95 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  30.42 
 
 
347 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  31.34 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  34.42 
 
 
342 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  31.04 
 
 
328 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  33.84 
 
 
324 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  35.77 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
330 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
337 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  32.15 
 
 
345 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  32.15 
 
 
345 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  35.18 
 
 
327 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  32.15 
 
 
345 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.45 
 
 
331 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  32.15 
 
 
345 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  32.15 
 
 
345 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  34.21 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.21 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.15 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  34.21 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  34.21 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  34.21 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  34.21 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 
340 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  33.92 
 
 
339 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  34.13 
 
 
334 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  32.66 
 
 
339 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 
338 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  30.56 
 
 
340 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.75 
 
 
328 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  33.87 
 
 
333 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
342 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  32.16 
 
 
338 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  35.55 
 
 
339 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  30.79 
 
 
336 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 
366 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.38 
 
 
345 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  29.2 
 
 
361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 
366 aa  135  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
341 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  33.92 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  34.04 
 
 
338 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  30.61 
 
 
340 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  30.03 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>