More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2918 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
330 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  95.15 
 
 
330 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  86.32 
 
 
330 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  72.64 
 
 
329 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  72.95 
 
 
334 aa  474  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  71.73 
 
 
330 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  70.21 
 
 
334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  54.6 
 
 
329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  53.33 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  53.21 
 
 
327 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.91 
 
 
328 aa  322  7e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  49.54 
 
 
330 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  49.85 
 
 
328 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  47.42 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  49.85 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  48.92 
 
 
328 aa  309  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  48.02 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  48.32 
 
 
336 aa  301  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  46.75 
 
 
328 aa  301  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  48.93 
 
 
328 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  46.44 
 
 
328 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  47.55 
 
 
331 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  47.59 
 
 
317 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  47.11 
 
 
338 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  46.67 
 
 
330 aa  292  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.11 
 
 
342 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.01 
 
 
353 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  46.79 
 
 
328 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.4 
 
 
328 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  47.4 
 
 
328 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  47.4 
 
 
328 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  46.34 
 
 
339 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  49.23 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  47.58 
 
 
333 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.77 
 
 
335 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  47.42 
 
 
339 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  47.42 
 
 
339 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  48.17 
 
 
389 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  46.81 
 
 
339 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.81 
 
 
339 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  46.81 
 
 
339 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  46.81 
 
 
339 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  46.81 
 
 
339 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  46.81 
 
 
339 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  42.25 
 
 
334 aa  268  8e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  41.69 
 
 
336 aa  263  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  44.75 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.08 
 
 
341 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  41.82 
 
 
342 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  42.04 
 
 
336 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  42.14 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.45 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  42.45 
 
 
341 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  42.45 
 
 
341 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  44.85 
 
 
326 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  42.81 
 
 
334 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  40.66 
 
 
340 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  37.65 
 
 
347 aa  239  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  42.64 
 
 
338 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  42.28 
 
 
316 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  41.95 
 
 
316 aa  222  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  39.39 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  47.98 
 
 
287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 
329 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  35.05 
 
 
342 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  36.25 
 
 
337 aa  202  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  40.38 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  39.04 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  40.33 
 
 
347 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  38.37 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  34.35 
 
 
338 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  37.54 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  37.39 
 
 
347 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  35.52 
 
 
338 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  35.01 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  34.43 
 
 
340 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  36.47 
 
 
344 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  36.87 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  38.25 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  36.36 
 
 
323 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  33.73 
 
 
330 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 
338 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.2 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 
344 aa  165  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  34.68 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  32.22 
 
 
334 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  36.42 
 
 
325 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 
340 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
337 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51869  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.05 
 
 
301 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 
366 aa  146  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  33.04 
 
 
345 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  33.04 
 
 
345 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
341 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 
341 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 
342 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  34.12 
 
 
368 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  33.04 
 
 
345 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>