More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3046 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  98.48 
 
 		 328 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  77.44 
 
 		 328 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  75.61 
 
 		 328 aa  517  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  76.22 
 
 		 328 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 		 336 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  50.3 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  53.73 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  50.47 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  48.48 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.78 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  48.78 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  48.78 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  47.56 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.78 
 
 		 353 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  49.23 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.77 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  46.79 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  50 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  47.84 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  45.62 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  46.48 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.09 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  46.48 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  46.48 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.48 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  46.48 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  46.48 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  46.48 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  45.87 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.34 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  49.66 
 
 		 339 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  45.92 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.57 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  46.95 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  48 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.15 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.09 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  43.67 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  44.88 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  47.54 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.82 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.23 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  43.16 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  41.23 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  41.23 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  40.71 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  41.03 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  40.92 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  42.15 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  43.43 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  40.87 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  44.12 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  41.82 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  44.49 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  44.07 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  38.58 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  40.19 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  40.19 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  44.97 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  39.55 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  35.63 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  36.92 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  38.86 
 
 		 335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  38.82 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  34.43 
 
 		 342 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  38.28 
 
 		 341 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  34.35 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  33.03 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  33.84 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  30.4 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  34.04 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  32.63 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.67 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  33.64 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  37.46 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  33.44 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.04 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  33.03 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  33.54 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  32.33 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  34.46 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  33.33 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  32.44 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.23 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  34.67 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.55 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  31.05 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  32.04 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  32.04 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.25 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>