More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1660 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  99.41 
 
 
339 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  99.41 
 
 
339 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  99.41 
 
 
339 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  99.41 
 
 
339 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  99.41 
 
 
339 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
339 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  99.41 
 
 
339 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  93.22 
 
 
339 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  85.42 
 
 
338 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  85.37 
 
 
342 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  84.98 
 
 
339 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  73.09 
 
 
353 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  72.78 
 
 
328 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  72.48 
 
 
328 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  72.48 
 
 
328 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  72.48 
 
 
328 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  72.48 
 
 
328 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  64.13 
 
 
331 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  52.58 
 
 
336 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.69 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  46.48 
 
 
328 aa  301  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  45.87 
 
 
328 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  49.24 
 
 
327 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  53.77 
 
 
334 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 
334 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.77 
 
 
329 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  47.42 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  46.81 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.93 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  43.43 
 
 
328 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  44.68 
 
 
332 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  45.26 
 
 
328 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  46.83 
 
 
331 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  43.12 
 
 
328 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  48.92 
 
 
330 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  49.24 
 
 
389 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  47.87 
 
 
330 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  42.04 
 
 
336 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  48.01 
 
 
334 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.61 
 
 
335 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.54 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  42.94 
 
 
334 aa  263  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  43.49 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  44.04 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.38 
 
 
341 aa  248  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.06 
 
 
341 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  39.06 
 
 
341 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  39.06 
 
 
341 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  41.43 
 
 
337 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  40.85 
 
 
342 aa  245  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  42.77 
 
 
317 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  38.44 
 
 
341 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  43.5 
 
 
333 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  42.73 
 
 
336 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  40.41 
 
 
347 aa  229  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  41.64 
 
 
287 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  42.25 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  38.24 
 
 
316 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  43.64 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  35.56 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  37.3 
 
 
316 aa  212  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  40.61 
 
 
335 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  37.9 
 
 
337 aa  209  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  40.67 
 
 
326 aa  208  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  38.86 
 
 
342 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  37.46 
 
 
338 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  38.25 
 
 
334 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  41.83 
 
 
347 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  38.1 
 
 
342 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  38.89 
 
 
338 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 
329 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  37.91 
 
 
347 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  39.27 
 
 
328 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  34.76 
 
 
340 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 
324 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  39.53 
 
 
368 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.61 
 
 
335 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  35.82 
 
 
344 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  35.56 
 
 
334 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  35.47 
 
 
345 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  35.47 
 
 
345 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  36.42 
 
 
323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  35.47 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  35.47 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 
345 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  35.24 
 
 
330 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  34.23 
 
 
338 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  36.72 
 
 
333 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.26 
 
 
331 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.76 
 
 
349 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  35.06 
 
 
338 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  35.55 
 
 
345 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  36.12 
 
 
340 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 
344 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  39.57 
 
 
352 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  36.04 
 
 
340 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  39.56 
 
 
336 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  36.01 
 
 
349 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>