More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0088 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 		 349 aa  718    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  71.76 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  55.75 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  41.25 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  40.29 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  39.35 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  39.35 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  39.35 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  39.35 
 
 		 345 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  39.05 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  39.05 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  38.78 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  36.8 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  35.34 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  36.63 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.59 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  33.24 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  32.96 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  33.72 
 
 		 355 aa  206  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  31.86 
 
 		 335 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.21 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  30.12 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  32.94 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  28.9 
 
 		 340 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  32.3 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  32.06 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.71 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  31.03 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.18 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.66 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.35 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.35 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  30.06 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.05 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  31.12 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  31.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  31.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  31.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  31.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  31.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.68 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  30.86 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  30.41 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  31.16 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  30.21 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  30.99 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.91 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.86 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  31.96 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  31.61 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  28.07 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.67 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  30.59 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  27.73 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1451  oxidoreductase family protein  36.62 
 
 		 580 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  30.46 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  28.93 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  29.48 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  27.73 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  28.49 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.27 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  31.11 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  27.73 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.81 
 
 		 287 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  29.07 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  29.36 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  29.94 
 
 		 328 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.51 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.03 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  28.34 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>