More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0653 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  54.76 
 
 
337 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  55.82 
 
 
338 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  56.42 
 
 
336 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  56.12 
 
 
337 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  53.73 
 
 
336 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  54.33 
 
 
337 aa  361  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  53.71 
 
 
336 aa  359  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  55.52 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  55.22 
 
 
335 aa  355  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  56.72 
 
 
337 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  56.72 
 
 
337 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  56.12 
 
 
337 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  51.04 
 
 
336 aa  348  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  55.82 
 
 
337 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  55.82 
 
 
337 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  54.63 
 
 
337 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  55.82 
 
 
337 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  52.21 
 
 
336 aa  332  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  52.24 
 
 
335 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  48.75 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  44.94 
 
 
336 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  51.49 
 
 
341 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  51.49 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  48.43 
 
 
341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  43.6 
 
 
348 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  41.79 
 
 
343 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  42.35 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  40.99 
 
 
367 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  39.64 
 
 
337 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  41.19 
 
 
342 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  41.25 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.42 
 
 
347 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.06 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
337 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.09 
 
 
350 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  34.04 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
340 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.02 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
334 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
342 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  29.45 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  31.8 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.43 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 
340 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.13 
 
 
335 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.04 
 
 
337 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.13 
 
 
335 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.13 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 
366 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  28.86 
 
 
345 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  28.86 
 
 
345 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  28.86 
 
 
345 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  27.13 
 
 
342 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 
331 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 
366 aa  113  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  29.41 
 
 
345 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  29.41 
 
 
345 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.86 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.48 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 
366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  30.91 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.92 
 
 
329 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  27.51 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  31.16 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
366 aa  109  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
337 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.1 
 
 
330 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 
361 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  29.05 
 
 
340 aa  106  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  30.79 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.67 
 
 
339 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  27.73 
 
 
341 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.67 
 
 
353 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
330 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
330 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  30.12 
 
 
389 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 
387 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  29.88 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  27 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.94 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
332 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  28.01 
 
 
368 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.52 
 
 
335 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  28.82 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.36 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  29.19 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  29.57 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>