More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1336 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 328 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  96.65 
 
 		 328 aa  658    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  85.67 
 
 		 328 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  76.22 
 
 		 328 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  76.22 
 
 		 328 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  51.84 
 
 		 336 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  52.15 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  51.38 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.08 
 
 		 329 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.21 
 
 		 329 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  47.56 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  49.85 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  51.53 
 
 		 334 aa  301  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  51.7 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  49.54 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.85 
 
 		 353 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.55 
 
 		 328 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  47.55 
 
 		 328 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  47.55 
 
 		 328 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.54 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  47.71 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  51.08 
 
 		 334 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  46.79 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  47.09 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.09 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.71 
 
 		 335 aa  289  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  45.59 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  44.31 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  46.36 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  43.69 
 
 		 338 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  44 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.27 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.27 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  48.91 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  48.91 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  46.44 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  48.54 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  43.12 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  44.41 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  43.12 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.12 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  43.12 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  43.12 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  43.12 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  43.12 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  42.42 
 
 		 336 aa  262  8e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  47.08 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  42.42 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  40.79 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  41.41 
 
 		 342 aa  252  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  43.37 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  43.37 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  40.56 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  52.21 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  43.12 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  40.43 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  40.8 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  40.19 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  35.78 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  35.84 
 
 		 347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  38.48 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  43.94 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  40.65 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  37.66 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  38.76 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  35.33 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  34.24 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.15 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  34.56 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  34.53 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  33.84 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  32.64 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  33.74 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  34.06 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  32.93 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  37 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  34.53 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  33.03 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.15 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  34.23 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  32.6 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  32.63 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  32.52 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  34.41 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  34.32 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.85 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1848  Inositol 2-dehydrogenase  34.35 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0363596  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.65 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51869  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.08 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  29.94 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>