More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  100 
 
 
317 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  69.28 
 
 
330 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  63.02 
 
 
330 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  63.14 
 
 
331 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  62.38 
 
 
330 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  47.59 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  47.27 
 
 
330 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.84 
 
 
329 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  45.13 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.72 
 
 
334 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.38 
 
 
329 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  45.69 
 
 
328 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  42.36 
 
 
331 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.4 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  45.05 
 
 
328 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  47.91 
 
 
330 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.05 
 
 
328 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  45.05 
 
 
328 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  45.66 
 
 
328 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.33 
 
 
342 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  44.55 
 
 
333 aa  249  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.41 
 
 
353 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  43.62 
 
 
338 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  42.77 
 
 
336 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  50 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  44.09 
 
 
339 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  44.2 
 
 
327 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  43.88 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  40.19 
 
 
328 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  40.19 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  42.24 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  43.53 
 
 
339 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  43.53 
 
 
339 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.53 
 
 
339 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  43.53 
 
 
339 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  43.53 
 
 
339 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  43.53 
 
 
339 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  39.55 
 
 
328 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  39.55 
 
 
328 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.07 
 
 
328 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  42.81 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  38.83 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  39.87 
 
 
316 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  39.54 
 
 
316 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  41.75 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  37.72 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  37.99 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  37.72 
 
 
341 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.72 
 
 
341 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  37.72 
 
 
341 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  42.75 
 
 
389 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.37 
 
 
341 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.5 
 
 
335 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  40.45 
 
 
326 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  39.81 
 
 
334 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  39.61 
 
 
334 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  35.16 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  40.76 
 
 
338 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  37.1 
 
 
337 aa  198  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  36.52 
 
 
336 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  37.22 
 
 
335 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  34.3 
 
 
347 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  40.64 
 
 
287 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  37.06 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  35.83 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.08 
 
 
329 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  31.73 
 
 
342 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  30.62 
 
 
338 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.92 
 
 
331 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.55 
 
 
337 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  32.48 
 
 
333 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  34.2 
 
 
338 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  30.32 
 
 
340 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  30.62 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
337 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  31.82 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  31.16 
 
 
344 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 
366 aa  136  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.44 
 
 
339 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 
366 aa  135  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  32.48 
 
 
344 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  32.59 
 
 
340 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  31.34 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  33.81 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  30.25 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.01 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  31.76 
 
 
362 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 
340 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
341 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  28.52 
 
 
334 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 
361 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  33.81 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  31.69 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 
366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>