More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1699 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  678    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  80.06 
 
 
326 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  46.91 
 
 
329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  41.09 
 
 
334 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  44.04 
 
 
335 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  43.16 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  43.16 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  43.12 
 
 
328 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  42.81 
 
 
328 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  42.22 
 
 
341 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.54 
 
 
341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  42.54 
 
 
341 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  42.54 
 
 
341 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.9 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.21 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.39 
 
 
335 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  42.55 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  41.77 
 
 
332 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  42.31 
 
 
344 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.6 
 
 
334 aa  238  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  41.9 
 
 
327 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  42.17 
 
 
336 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  39.65 
 
 
342 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  38.74 
 
 
336 aa  232  6e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.99 
 
 
330 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.43 
 
 
328 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  42.81 
 
 
330 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.98 
 
 
329 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  40.3 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  41.54 
 
 
330 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  38.36 
 
 
316 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  43.5 
 
 
334 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  42.81 
 
 
389 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  38.01 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  37.74 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  41.82 
 
 
330 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  39.27 
 
 
330 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  43.77 
 
 
287 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  38.92 
 
 
338 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  42.86 
 
 
334 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  39.26 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.88 
 
 
353 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.02 
 
 
342 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  39.58 
 
 
331 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  38.18 
 
 
331 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  41.92 
 
 
330 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.37 
 
 
328 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  40.37 
 
 
328 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  40.98 
 
 
328 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  38.3 
 
 
330 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  40.37 
 
 
328 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  37.43 
 
 
342 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  39.05 
 
 
347 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  37.61 
 
 
338 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  37.76 
 
 
333 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  36.34 
 
 
336 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  39.81 
 
 
317 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  34.73 
 
 
340 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  37.95 
 
 
339 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  38.86 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  37.05 
 
 
340 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  37.65 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.65 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  37.65 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  37.65 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  37.65 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  37.65 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  38.41 
 
 
337 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  34.72 
 
 
347 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  38.51 
 
 
333 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.82 
 
 
335 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  34.85 
 
 
340 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  35.24 
 
 
334 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  36.05 
 
 
344 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  39.51 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  36.86 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 
366 aa  178  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  36.83 
 
 
338 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 
342 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  33.43 
 
 
366 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  35.91 
 
 
338 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  38.67 
 
 
323 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  34.03 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.39 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  35.78 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  37.65 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  37.16 
 
 
338 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
337 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  36.94 
 
 
352 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  34.23 
 
 
345 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  34.23 
 
 
345 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  34.23 
 
 
345 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  34.23 
 
 
345 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  34.23 
 
 
345 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  34.51 
 
 
340 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  34.14 
 
 
340 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  34.63 
 
 
368 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 
365 aa  161  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  35.42 
 
 
347 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 
342 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>