More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4486 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  48.07 
 
 
340 aa  334  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  52.54 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  49.25 
 
 
323 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  48.97 
 
 
342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  47.63 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  47.21 
 
 
344 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  46.31 
 
 
338 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  47.01 
 
 
334 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  48.06 
 
 
333 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  49.11 
 
 
347 aa  279  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  44.48 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  50.9 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.32 
 
 
339 aa  259  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  43.75 
 
 
331 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  44.87 
 
 
341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  38.44 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  35.69 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  37.06 
 
 
336 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  35.59 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  38.87 
 
 
326 aa  188  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  37.37 
 
 
330 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.76 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.25 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  32.63 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  32.04 
 
 
328 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  35.91 
 
 
334 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
328 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  33.03 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.03 
 
 
341 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  30.03 
 
 
336 aa  172  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
328 aa  172  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  33.03 
 
 
341 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  33.03 
 
 
341 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  36.12 
 
 
330 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 
329 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.24 
 
 
330 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
328 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  33.45 
 
 
334 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.13 
 
 
341 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  31.87 
 
 
342 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  35.47 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  33.02 
 
 
316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  33.02 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.85 
 
 
331 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  32.54 
 
 
330 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  31.37 
 
 
330 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  33.83 
 
 
344 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 
329 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  31.76 
 
 
347 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 
332 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  35.14 
 
 
328 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  35.14 
 
 
328 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  31.45 
 
 
331 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.14 
 
 
328 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  35.14 
 
 
328 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  33.67 
 
 
333 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.96 
 
 
328 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.8 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  33.57 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  34.04 
 
 
339 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
338 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  30.93 
 
 
327 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.93 
 
 
342 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  34.85 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  29.81 
 
 
330 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  34.23 
 
 
339 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 
337 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.25 
 
 
337 aa  149  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  34.9 
 
 
389 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  35.62 
 
 
339 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  33.93 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.93 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  33.93 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  33.93 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  33.93 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  33.93 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  33.73 
 
 
338 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.55 
 
 
350 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  33.54 
 
 
334 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  31.8 
 
 
336 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.93 
 
 
349 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  30.62 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  28.82 
 
 
340 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
349 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  33.55 
 
 
347 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  34.98 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  37.97 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  32.39 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 
365 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  31.59 
 
 
338 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.65 
 
 
345 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  30.87 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>