More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0031 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 341 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  67.34 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  48.81 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  49.11 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  45.81 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  44.64 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  47.02 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  45.56 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  45.1 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  45.43 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  44.94 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  45.37 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  43.36 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.51 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  46.87 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  42.86 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  38.1 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  39.41 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  37.84 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  34.95 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  34.55 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  36.65 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  32.25 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  31.6 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  37.09 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.48 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.6 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  34.91 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  31.6 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  31.6 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  35.52 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  37.14 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  38.55 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.54 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  38.08 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  32.17 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  32.25 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  36.09 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  33.72 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.13 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.3 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  37.87 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  28.28 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.4 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  36.23 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  36.44 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  36.23 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  36.63 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.24 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  35.97 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  36.23 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  36.23 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  36.23 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  32.27 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 		 366 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  34.77 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.82 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  33.23 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  34.73 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  34.81 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.05 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.65 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  30.34 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.04 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  30.96 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.06 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  35.34 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  34.2 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  33.11 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  35.59 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  31.5 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  35.08 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  31.12 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>