More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1361 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 333 aa  658    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  52.34 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.43 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.7 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  45.43 
 
 		 332 aa  291  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  46.48 
 
 		 330 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.79 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  47.58 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  47.27 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  48.32 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  48.94 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  49.07 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  47.66 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  53.66 
 
 		 338 aa  275  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  47.35 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  45.09 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  47.08 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  46.93 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  47.26 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  48.04 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.43 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  46.48 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.34 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  44.55 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  43.94 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  42.81 
 
 		 330 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  46.81 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  48 
 
 		 347 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  46.53 
 
 		 389 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  44.38 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.38 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  44.38 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  44.34 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.96 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  41.46 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.94 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  40.79 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  40.18 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  41.59 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  39.58 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  42.73 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.01 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  37.96 
 
 		 341 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.96 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  37.96 
 
 		 341 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  37.96 
 
 		 341 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  37.39 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  39.26 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  37.76 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  37.77 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  39.73 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  40.07 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  37.84 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  36.39 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  39.35 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  39.19 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  36.11 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  36.58 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  34.22 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  32.94 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  35.26 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  36.14 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  38.51 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  35.37 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  34.93 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  34.71 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  33.83 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  35.26 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.69 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.02 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  34.51 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  35.83 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  36.18 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  36.18 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  36.18 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  36.18 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  36.18 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.84 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  36.25 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.24 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  33.02 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  37.39 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.9 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  35.88 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  34.63 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  36.81 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  35.64 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>