More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0506 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  671    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  52.4 
 
 
336 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.24 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  52.1 
 
 
342 aa  347  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.16 
 
 
341 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  50.16 
 
 
341 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  50.16 
 
 
341 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.53 
 
 
341 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  49.22 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  49.22 
 
 
341 aa  334  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  53.38 
 
 
287 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  47.4 
 
 
328 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  47 
 
 
316 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  46.79 
 
 
328 aa  295  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  45.74 
 
 
316 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  45.59 
 
 
328 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  45.62 
 
 
328 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  45.9 
 
 
328 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  44.31 
 
 
336 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.44 
 
 
334 aa  279  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  44.68 
 
 
326 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  40.48 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  41.69 
 
 
340 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  44.95 
 
 
334 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.84 
 
 
330 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.68 
 
 
329 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.03 
 
 
329 aa  268  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  42.25 
 
 
339 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  41.09 
 
 
334 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  41.89 
 
 
332 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  42.25 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  40.42 
 
 
335 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  43.2 
 
 
330 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  41.27 
 
 
338 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  42.77 
 
 
334 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.66 
 
 
342 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  42.42 
 
 
389 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  42.94 
 
 
339 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.34 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  42.64 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.64 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  42.64 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  42.64 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  42.64 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  42.64 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  41.03 
 
 
327 aa  252  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  42.3 
 
 
339 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  43.5 
 
 
330 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  41.21 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  40.67 
 
 
328 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  42.3 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  39.04 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.51 
 
 
353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  39.82 
 
 
328 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  38.97 
 
 
331 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  39.51 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.51 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  39.51 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  46.15 
 
 
342 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  40.73 
 
 
331 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  41.46 
 
 
333 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  36.61 
 
 
344 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  40.18 
 
 
336 aa  222  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  39.34 
 
 
330 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.69 
 
 
335 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  36.72 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  40.72 
 
 
338 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  35.99 
 
 
342 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.24 
 
 
350 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  36.44 
 
 
338 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  36.14 
 
 
338 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  36.31 
 
 
329 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  35.57 
 
 
347 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  37.87 
 
 
328 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  39.61 
 
 
317 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  34.93 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  35.74 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
337 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  35.63 
 
 
333 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.45 
 
 
349 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  35.01 
 
 
345 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  35.01 
 
 
345 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  34.72 
 
 
345 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 
345 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  34.72 
 
 
345 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  36.72 
 
 
323 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  35.12 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  35.82 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  35.59 
 
 
338 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  35.5 
 
 
345 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  36.83 
 
 
340 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  40.5 
 
 
352 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  37.66 
 
 
341 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  35.03 
 
 
339 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  35.24 
 
 
331 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  37.22 
 
 
347 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  35.81 
 
 
368 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 
324 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  31.36 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>