More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3338 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  66.06 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  66.97 
 
 		 330 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  63.02 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  58.91 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  44.85 
 
 		 332 aa  308  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  47.42 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.48 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.22 
 
 		 329 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  49 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  51.8 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  49.35 
 
 		 330 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  52.13 
 
 		 334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  43.54 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.71 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  43.83 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  42.73 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  42.81 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  42.94 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.81 
 
 		 342 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  43.93 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  41.87 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  41.34 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  43.49 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  39.7 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  41.21 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  42.68 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.26 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  43.17 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.17 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  43.17 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  43.17 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  43.17 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  43.17 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  38.18 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  41.57 
 
 		 389 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  42.02 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.82 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  38.58 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  38.58 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.45 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  37.5 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  37.85 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  39.34 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  37.85 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.11 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  36.79 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.79 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  36.48 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  36.79 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  38.3 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  33.33 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  38.01 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  39.64 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  39.31 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  35.95 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  32.52 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  38.32 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  37.55 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  36.04 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  35.56 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  33.94 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  32.22 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  32.91 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.96 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  31.4 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  31.66 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  30.91 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  34.83 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  32.5 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  32.18 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  35.74 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  31.97 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  29.81 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  32.51 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.26 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  36.23 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  32.63 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  31.55 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  30.68 
 
 		 341 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  32.53 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>