More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0276 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 338 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  58.88 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  53.66 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  47.45 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  44.44 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.57 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  42.04 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  45.65 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  44.24 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  44.24 
 
 		 328 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  43.84 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  47.92 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.57 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.98 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  43.54 
 
 		 330 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  45.4 
 
 		 347 aa  235  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  42.62 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.07 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.72 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  43.67 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  41.37 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  41.54 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  44.14 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  45.54 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  45.78 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  39.64 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  39.94 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  40.65 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.28 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  44.78 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  44.58 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.58 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  44.58 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  40.76 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  43.64 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  43.64 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.64 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  43.64 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  43.64 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  43.64 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  43.64 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  41.11 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  40.84 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.07 
 
 		 342 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  40.48 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  44.33 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  38.07 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  37.13 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.52 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  34.78 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  35.33 
 
 		 347 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.37 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  35.52 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.37 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  40.68 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  36.11 
 
 		 337 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  34.37 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  34.37 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  41.49 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  40.3 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  38.25 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  37.24 
 
 		 340 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  36.5 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  36.57 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  38.14 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  36.23 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  36.12 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  36.97 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  31.27 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  36.24 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  34.33 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  35.28 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  34.13 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  34.64 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.33 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  38.18 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  35.78 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  34.22 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  34.22 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  33.92 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  33.92 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  33.92 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  33.92 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.59 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.28 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.9 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  37.09 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.24 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  35.29 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  31.29 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>