More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3352 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 329 aa  672    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  66.77 
 
 		 328 aa  427  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  61.04 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  53.96 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.8 
 
 		 329 aa  341  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  54.6 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  54.67 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.44 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  54.97 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  55.35 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  56.25 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  49.39 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  49.08 
 
 		 328 aa  308  8e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  49.39 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  50.47 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  50.16 
 
 		 328 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  50.91 
 
 		 336 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  48.48 
 
 		 328 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  47.13 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.78 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  48.15 
 
 		 339 aa  298  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  48.48 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.48 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  47.38 
 
 		 338 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  48.48 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  47.69 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.77 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.18 
 
 		 335 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  47.38 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  47.38 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.38 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  47.38 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  47.38 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  47.38 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  50 
 
 		 389 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  44.41 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  43.54 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  47.08 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  45.62 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  46.2 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  44.71 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  42.68 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.22 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  42.59 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.9 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  42.9 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  42.9 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  46.38 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  43.43 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  43.61 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  43.26 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  41.03 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  44.62 
 
 		 326 aa  248  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  43.12 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  44.21 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  45.26 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  43.38 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  45.72 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  45.72 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  38.86 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  44.26 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  39.94 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  37.08 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  37.99 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  38.46 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  37.39 
 
 		 344 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  36.06 
 
 		 347 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  39.52 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  36.28 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  39.14 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  35.45 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  34.23 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  34.81 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  34.76 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  34.64 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  36.59 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  35.17 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  33.03 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.94 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  37.06 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.14 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  33.92 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  34.41 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  34.41 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  31.99 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  36.3 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  34.41 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  34.41 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  34.41 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  34.31 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  32.07 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.54 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>