More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0085 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 335 aa  683    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  59.94 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  60.19 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  49.24 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.56 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  51.25 
 
 		 341 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  50.62 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  51.25 
 
 		 341 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  50.94 
 
 		 341 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  54.48 
 
 		 287 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  45.62 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  44.71 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.18 
 
 		 329 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  44.41 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  44.44 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  40.72 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  44.13 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  46.04 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  41.69 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  42.77 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  41.99 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  41.09 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  40.48 
 
 		 328 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.3 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  42.17 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.65 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  40.61 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.11 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  43.07 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.77 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  42.39 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  40.18 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  40.12 
 
 		 347 aa  262  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  42.99 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.88 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  39.27 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  40.61 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  39.58 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.58 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  39.58 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.87 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  40.3 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  40.42 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  40.67 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  41.57 
 
 		 330 aa  252  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  42.47 
 
 		 334 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  39.39 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  40.36 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  38.86 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  39.34 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  36.45 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  36.36 
 
 		 344 aa  228  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  37.01 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  35.84 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  34.13 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  35.5 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35.89 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.63 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  33.24 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  32.94 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  37 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  32.54 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  33.24 
 
 		 366 aa  188  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.21 
 
 		 349 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 		 366 aa  185  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  32.93 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  33.72 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  32.37 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  32.06 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  31.83 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  31.12 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  31.95 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  34.23 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.5 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  31.36 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  31.36 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  31.07 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  31.07 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  31.07 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.53 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  31.36 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  32.45 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>