More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0056 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  776    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  74.4 
 
 
336 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  68.1 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  52.15 
 
 
328 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  51.84 
 
 
328 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  50.3 
 
 
328 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  49.7 
 
 
328 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  50.3 
 
 
328 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  50 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.39 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  50.76 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  50.91 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  48.17 
 
 
328 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  50 
 
 
330 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  48.17 
 
 
330 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  47.71 
 
 
330 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  49.24 
 
 
339 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  49.24 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  49.24 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  47.26 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  49.24 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  49.24 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  49.24 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  49.24 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  47.26 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  46.95 
 
 
328 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  46.95 
 
 
339 aa  282  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.95 
 
 
328 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.07 
 
 
335 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  46.95 
 
 
328 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  46.95 
 
 
328 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  46.79 
 
 
338 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  45.32 
 
 
331 aa  279  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  46.48 
 
 
342 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  47.87 
 
 
330 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  46.67 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  42.42 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  48.78 
 
 
334 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  48.01 
 
 
339 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  46.81 
 
 
331 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  268  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  45.15 
 
 
332 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  45.62 
 
 
330 aa  265  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  44.44 
 
 
337 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  46.67 
 
 
333 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  41.57 
 
 
330 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.68 
 
 
341 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.68 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  40.68 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  40.68 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  40.37 
 
 
341 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  40.3 
 
 
342 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  42.73 
 
 
336 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  47.46 
 
 
338 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  42.81 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  41.51 
 
 
316 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  41.19 
 
 
316 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  43.56 
 
 
326 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  42.32 
 
 
287 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  41.37 
 
 
317 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  37.61 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  37.87 
 
 
342 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  35.05 
 
 
340 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  38.97 
 
 
335 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  36.97 
 
 
340 aa  202  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 
338 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  42.21 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  37.24 
 
 
333 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  36.61 
 
 
344 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  39.23 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  41.98 
 
 
342 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  37.13 
 
 
340 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 
329 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  36.86 
 
 
347 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  35.05 
 
 
328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
337 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  36.06 
 
 
338 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.93 
 
 
331 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.87 
 
 
339 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  37.5 
 
 
339 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.14 
 
 
350 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  38.28 
 
 
338 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  40.3 
 
 
352 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  32.62 
 
 
334 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  35.61 
 
 
341 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.04 
 
 
338 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  31.91 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  34.04 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.75 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  37.05 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  33.24 
 
 
361 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  33.94 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 
366 aa  159  8e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 
366 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  38.23 
 
 
325 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
366 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
337 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  30.9 
 
 
366 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
340 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>