More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2344 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  90.43 
 
 		 334 aa  587  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  50.78 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  49.53 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  46.6 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  46.01 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  47.04 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  43.12 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  50.16 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  45.31 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.65 
 
 		 339 aa  258  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0031  oxidoreductase domain protein  44.44 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  41.85 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  44.55 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  40.5 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  41.74 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  39.57 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  33.96 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  33.86 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  36.05 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  36.76 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  39.32 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  38.7 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.51 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  38.06 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.06 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  38.06 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  31.69 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  38.03 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  38.63 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  38.25 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.53 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  32.6 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.38 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.38 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  38.63 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.63 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  38.63 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  38.63 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  38.63 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  38.63 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  31.38 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  31.38 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.02 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  37.78 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  34.78 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  32.01 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  31.56 
 
 		 316 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  31.56 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  34.59 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.51 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  32.23 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  32.5 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  31.94 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.82 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.72 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  36.75 
 
 		 342 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.49 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  31.55 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  37.41 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  30.79 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  33.23 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.53 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  33.09 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  33.22 
 
 		 389 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  33.72 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  28.48 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.2 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  32.15 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  32.93 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.94 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  32.95 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  32.87 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.53 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1982  Inositol 2-dehydrogenase  35.69 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0855284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  32.96 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  34.67 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  35.29 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  35.29 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  34.93 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  34.93 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  35.12 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>