More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2747 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 362 aa  721    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  60.64 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  60.68 
 
 		 367 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  61.06 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  59.64 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  60.18 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  50.3 
 
 		 337 aa  322  9.000000000000001e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  50 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  44.15 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  45.72 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  43.62 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.32 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  41.25 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  41.84 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  42.31 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  44.38 
 
 		 337 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  42.35 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.01 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  43.49 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  44.38 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  42.43 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.08 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  44.08 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  44.92 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.49 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.38 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  41.28 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  43.38 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  40.71 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  40.36 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  43.12 
 
 		 341 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  42.09 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  36.69 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.69 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.85 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.81 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  35 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  33.82 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  30.32 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.57 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  31.76 
 
 		 317 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  26.84 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  29.75 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  29.75 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  29.75 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  29.75 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  29.75 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.51 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  32.69 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.69 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  32.69 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.07 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  31.51 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 349 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  27.67 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  33.44 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  32.9 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.12 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  31.67 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.21 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.57 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.9 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.38 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  31.37 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  29.66 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  29.65 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.79 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 329 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  27.68 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.99 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  34.9 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  32.04 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  28.7 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.18 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  32.15 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.61 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.04 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  31.55 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  32.42 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  27.33 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>