More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1246 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  100 
 
 		 337 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  83.63 
 
 		 337 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  83.98 
 
 		 337 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  83.68 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  83.98 
 
 		 337 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  83.68 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  83.68 
 
 		 337 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  83.68 
 
 		 337 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  71.13 
 
 		 337 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  76.79 
 
 		 337 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  71.64 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  73.13 
 
 		 336 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  72.54 
 
 		 336 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  62.5 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  60.42 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  62.69 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  59.52 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  61.61 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  61.31 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  56.12 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  52.84 
 
 		 335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  52.82 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  49.01 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  44.35 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  41.79 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  41.19 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  42.12 
 
 		 348 aa  255  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  42.43 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  39.94 
 
 		 343 aa  235  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  38.9 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  37.65 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  38.79 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.45 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.27 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  29.22 
 
 		 342 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  30.28 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.5 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.44 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.14 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  30.29 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  31.01 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.95 
 
 		 350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.78 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.04 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  29.12 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  29.62 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  30.27 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.18 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.45 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.71 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.61 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.24 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1848  Inositol 2-dehydrogenase  33.76 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0363596  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  29.18 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  30.15 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.15 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  28.37 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  28.37 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  28.48 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  28.96 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  28.37 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  28.61 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  29.2 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  28.61 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  29.62 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  30.43 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  30.33 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.62 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  29.62 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  30.92 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  26.18 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  30.33 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  30.33 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.33 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  30.33 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  30.33 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  30.33 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>