More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0387 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  76.26 
 
 
342 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  74.19 
 
 
349 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  69.58 
 
 
367 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  60.64 
 
 
362 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  56.33 
 
 
348 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  48.49 
 
 
337 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  48.36 
 
 
337 aa  295  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  42.98 
 
 
335 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  41.79 
 
 
334 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  38.51 
 
 
338 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  37.61 
 
 
337 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  40.42 
 
 
335 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  41.76 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 
336 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.35 
 
 
337 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  42.01 
 
 
337 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.81 
 
 
336 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.96 
 
 
337 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  41.96 
 
 
337 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  42.06 
 
 
337 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  41.67 
 
 
337 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  39.94 
 
 
337 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  38.21 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  37.54 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  40.55 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  37.17 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  40.33 
 
 
337 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  38.96 
 
 
334 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.71 
 
 
341 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  35.36 
 
 
336 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  38.48 
 
 
360 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  32.83 
 
 
336 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  35 
 
 
347 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  31.7 
 
 
335 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  32.56 
 
 
331 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  30.99 
 
 
330 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  31.29 
 
 
330 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.66 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  33.66 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  33.66 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.84 
 
 
335 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  30.23 
 
 
328 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  31.35 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  30.7 
 
 
345 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  30.7 
 
 
345 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  30.7 
 
 
345 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.7 
 
 
345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.7 
 
 
345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  31.78 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.68 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  31.18 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 
337 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  29.45 
 
 
339 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.06 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.68 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  29.86 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  29.94 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  27.07 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.35 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  27.07 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  26.89 
 
 
347 aa  109  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  30.54 
 
 
323 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  29.67 
 
 
336 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.19 
 
 
341 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.78 
 
 
342 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 
329 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  29.41 
 
 
389 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  28.52 
 
 
368 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  26.01 
 
 
339 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.41 
 
 
341 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  27.62 
 
 
336 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  30.18 
 
 
334 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.88 
 
 
328 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
340 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  26.25 
 
 
331 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  31.78 
 
 
331 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.43 
 
 
336 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  31.29 
 
 
338 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.38 
 
 
341 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
337 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
328 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.38 
 
 
341 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 
334 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.13 
 
 
329 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
330 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 
328 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  31.99 
 
 
325 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.1 
 
 
334 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 
349 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  27.01 
 
 
338 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 
334 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
330 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  28.43 
 
 
328 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
347 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>