More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1308 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  99.11 
 
 		 337 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 337 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  97.92 
 
 		 337 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  97.92 
 
 		 337 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  96.44 
 
 		 337 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  96.44 
 
 		 337 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  92.86 
 
 		 337 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  83.98 
 
 		 337 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  72.54 
 
 		 338 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  71.43 
 
 		 337 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  75 
 
 		 337 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  71.64 
 
 		 336 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  71.94 
 
 		 336 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  63.99 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  63.88 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  58.04 
 
 		 336 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  58.04 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  56.72 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  61.9 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  61.9 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  49.55 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  52.84 
 
 		 335 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  52.52 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  45.43 
 
 		 360 aa  289  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  46.27 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  44.38 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  42.39 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  44.06 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  41.79 
 
 		 337 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  42.82 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  39.42 
 
 		 367 aa  232  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  39.82 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  39.27 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.76 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.41 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.43 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  27.58 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.09 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.67 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  28.65 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  29.18 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  29.28 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.71 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.36 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  29.62 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.6 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  29.39 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.24 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  31.01 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  28.93 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  29.26 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.51 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  29.25 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.75 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  28.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  28.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  28.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  28.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  28.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.7 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  26.84 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  27.21 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  28.85 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  27.1 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  28.2 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  26.57 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  26.57 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  26.57 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.2 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  28.2 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.3 
 
 		 335 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.81 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  31.3 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  27.98 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  26.27 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  25.38 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  27.79 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  26.27 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>