More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3283 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 341 aa  690    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  97.6 
 
 		 334 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  70.75 
 
 		 336 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  72.32 
 
 		 336 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  69.85 
 
 		 336 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  62.5 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  62.31 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  62.61 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  62.02 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  57.86 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  61.61 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  61.01 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  60.71 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  61.01 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  60.71 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  61.01 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  60.12 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  59.82 
 
 		 337 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  58.63 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  47.18 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  51.49 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  51.78 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  50.73 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  42.56 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  42.26 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  42.82 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  47.39 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  42.9 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  42.77 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  40.18 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  38.32 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  37.54 
 
 		 342 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  38.87 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.22 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  27.33 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.23 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.58 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.12 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.19 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.67 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.15 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  29.41 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  31.31 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  30.75 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  30.79 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  30.7 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  30.87 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.79 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  29.55 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  29.23 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.71 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  31.09 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  29.47 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  29.34 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.14 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  30.2 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.27 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  28.06 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.79 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  29.5 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  29.11 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  29.11 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.11 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  29.11 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  29.11 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  29.11 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.87 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.78 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  29.45 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  27.94 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  28.8 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  27.63 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  27.63 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  28.75 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  27.63 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  27.97 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  29.39 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.57 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  27.33 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  26.18 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  27.33 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  31.65 
 
 		 325 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.83 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>