More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0731 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
360 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  49.3 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  46.54 
 
 
337 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  45.03 
 
 
338 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.48 
 
 
336 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  46.96 
 
 
336 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.48 
 
 
336 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  42.54 
 
 
337 aa  275  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  46.71 
 
 
337 aa  275  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  48.8 
 
 
337 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  47.11 
 
 
335 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.71 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  45.98 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  45.71 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  42.94 
 
 
336 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  45.71 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  43.49 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  45.43 
 
 
337 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  44.88 
 
 
337 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.37 
 
 
341 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  44.44 
 
 
335 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  43.09 
 
 
334 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  42.15 
 
 
336 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  39.44 
 
 
337 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  39.72 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  43.28 
 
 
362 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  38.6 
 
 
336 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  42.51 
 
 
348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  39.76 
 
 
343 aa  222  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  41.59 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  37.36 
 
 
342 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  36.17 
 
 
367 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  38.41 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  37.7 
 
 
347 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
337 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
349 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.17 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  30.29 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  32.17 
 
 
345 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  32.17 
 
 
345 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  32.17 
 
 
345 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 
329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  31.85 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  31.85 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.89 
 
 
349 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.52 
 
 
340 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.04 
 
 
350 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  29.04 
 
 
342 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
330 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.98 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.6 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 
329 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 
389 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  29.85 
 
 
336 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  28.76 
 
 
338 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  28.02 
 
 
336 aa  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
340 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  31.85 
 
 
327 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.81 
 
 
330 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  29.32 
 
 
340 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 
334 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.07 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  27.18 
 
 
341 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  29.83 
 
 
334 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  27.56 
 
 
355 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  29.77 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  32.13 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  30.57 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  28.49 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  26.32 
 
 
339 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28.05 
 
 
328 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.57 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.1 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.72 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  32.93 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  31.3 
 
 
317 aa  93.2  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 
361 aa  92.4  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  25.66 
 
 
335 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  30.03 
 
 
328 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  29.14 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
350 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.52 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  30.13 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.79 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.43 
 
 
313 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>