More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1138 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 312 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  72.26 
 
 		 310 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  67.42 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  53.38 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  40.68 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  42.11 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  40.45 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 344 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  37.99 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  37.82 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  37.17 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  38.11 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  35.9 
 
 		 353 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  35.95 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  35.24 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  34.14 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  32.8 
 
 		 334 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  33.23 
 
 		 354 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 359 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  33.44 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  33.12 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  32.48 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  34.41 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  32.73 
 
 		 340 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  33.76 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  34.08 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  32.03 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  33.12 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  32.8 
 
 		 340 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  35.25 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  31.73 
 
 		 356 aa  168  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  35.39 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  33.43 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  32.93 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.92 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  32.04 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.84 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.58 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  33.23 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 341 aa  158  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 359 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.03 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.13 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 344 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  29.17 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  31.83 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  29.12 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  30.62 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  28.1 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  30.18 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  31.72 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  28.52 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  28.52 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  32.01 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.52 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 352 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  30 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  30.45 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.92 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  31.6 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  25.9 
 
 		 649 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>