More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0825 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  92.58 
 
 
337 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  50 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  51.67 
 
 
348 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  48.36 
 
 
343 aa  295  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  47.16 
 
 
342 aa  275  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  48.64 
 
 
349 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  44.38 
 
 
367 aa  268  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  39.88 
 
 
336 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  41.79 
 
 
337 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  39.7 
 
 
337 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.56 
 
 
341 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  42.56 
 
 
334 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  41.32 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  39.88 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  39.34 
 
 
334 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  38.81 
 
 
338 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  39.29 
 
 
336 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.12 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  41.54 
 
 
335 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  41.79 
 
 
337 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.52 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  41.79 
 
 
337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  39.44 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  41.49 
 
 
337 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.49 
 
 
337 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  41.49 
 
 
337 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.19 
 
 
337 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  35.82 
 
 
337 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  38.24 
 
 
337 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  33.13 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  38.44 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  36.53 
 
 
341 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.42 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 
335 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  31.6 
 
 
334 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  30.63 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.64 
 
 
329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  31.45 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.63 
 
 
335 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.42 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  30.97 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  27.94 
 
 
342 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.71 
 
 
336 aa  113  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  29.64 
 
 
327 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  34.13 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  31.35 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 
331 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.48 
 
 
330 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29 
 
 
329 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  29.82 
 
 
339 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  28.98 
 
 
334 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
337 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.49 
 
 
330 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  30.32 
 
 
330 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  29.39 
 
 
328 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.39 
 
 
328 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  29.39 
 
 
328 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
329 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  29.03 
 
 
338 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.14 
 
 
328 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35.12 
 
 
331 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  28.11 
 
 
342 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
336 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.6 
 
 
365 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  29.8 
 
 
328 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
334 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.19 
 
 
342 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
330 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  27.93 
 
 
338 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  26.16 
 
 
336 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
324 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  35.98 
 
 
332 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.79 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  36.04 
 
 
346 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28.14 
 
 
328 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  35.27 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.02 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  26.83 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.36 
 
 
349 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.22 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  27.58 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  35.14 
 
 
332 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  27.04 
 
 
340 aa  96.3  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  27.91 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  29.2 
 
 
331 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  29.45 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
334 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.73 
 
 
335 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  23.9 
 
 
347 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  26.79 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  29.2 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  29.2 
 
 
339 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>