More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2339 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  68.2 
 
 
332 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  69.04 
 
 
345 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  71.62 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  71.76 
 
 
331 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  68.81 
 
 
346 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  68.31 
 
 
335 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  67.85 
 
 
334 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  40.19 
 
 
313 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  39.47 
 
 
312 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  40.63 
 
 
344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  36.74 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  42.58 
 
 
340 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  36.14 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  35.67 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  36.3 
 
 
355 aa  195  9e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  35.06 
 
 
310 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  36.22 
 
 
361 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  40 
 
 
327 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
319 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 
322 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  33.88 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  34.49 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  34.18 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  34.06 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.18 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  35.37 
 
 
335 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  32.34 
 
 
354 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 
359 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
360 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  33.12 
 
 
340 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  36.1 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  32.8 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  35.87 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 
355 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  35.69 
 
 
340 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  34.08 
 
 
335 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  37.62 
 
 
332 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 
314 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.5 
 
 
319 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
334 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  35.11 
 
 
316 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  31.82 
 
 
310 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 
356 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 
356 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 
323 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  34.45 
 
 
346 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  35.02 
 
 
328 aa  166  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  33.77 
 
 
327 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.54 
 
 
317 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  32.48 
 
 
356 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  32.36 
 
 
313 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
338 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  38.76 
 
 
345 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  34.53 
 
 
312 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
341 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  34.47 
 
 
332 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 
337 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  33.97 
 
 
305 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.79 
 
 
310 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 
318 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  31.58 
 
 
320 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  31.58 
 
 
320 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
321 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  31.63 
 
 
649 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
320 aa  142  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.93 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.71 
 
 
288 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  33.01 
 
 
330 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.71 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
363 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.49 
 
 
317 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  29.52 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.71 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  34.24 
 
 
310 aa  133  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  30.19 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 
347 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 
343 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.54 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  31.56 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 
311 aa  126  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 
318 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  36.18 
 
 
326 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  29.91 
 
 
357 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
344 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.19 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>