More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2766 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 335 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  61.19 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  55.22 
 
 		 334 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  51.93 
 
 		 337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  52.08 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.08 
 
 		 336 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  51.79 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  51.48 
 
 		 336 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  51.18 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  52.82 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  51.93 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  52.52 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  52.52 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  52.52 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.52 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  52.52 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  52.52 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  51.33 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  46.73 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  52.58 
 
 		 337 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  51.81 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  41.67 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  51.53 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  49.85 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  45.72 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  46.18 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  43.33 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  40.42 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  39.82 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  38.62 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.55 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  39.16 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  38.44 
 
 		 337 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  39.76 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.82 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  31.52 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  28.36 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.54 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  30.33 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  33.11 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  32.24 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  32.64 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  33.24 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.29 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  30.89 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  27.01 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.91 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  30.03 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  32.07 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.68 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.33 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  31.33 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  31.33 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  34.57 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  35 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  31.64 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.44 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.79 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  31.94 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 		 387 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  32.14 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.64 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 		 368 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.26 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  28.91 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.7 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  29.29 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.29 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  29.29 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  31.66 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.44 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  37.05 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  30.87 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.62 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.12 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.65 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  31 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  31.76 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  26.38 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  30.15 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>