More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2417 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 337 aa  693    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  61.72 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  60.12 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  64.48 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  60.71 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  61.01 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  60.24 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  62.69 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  62.99 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  63.88 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  63.58 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  63.58 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  63.88 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  63.58 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  57.86 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  55.49 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  60.42 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  58.16 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  57.86 
 
 		 341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  54.33 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  50.15 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  47.92 
 
 		 335 aa  292  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  46.73 
 
 		 335 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  41.99 
 
 		 360 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  45.9 
 
 		 341 aa  245  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  37.01 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  39.33 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  39.07 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  40.36 
 
 		 362 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  35.82 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  37.54 
 
 		 343 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  36.75 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  37.07 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.92 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.16 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.65 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.7 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  28.22 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.81 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  28.48 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.84 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  31.36 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.06 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.16 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.24 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.45 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.69 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  26.71 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.14 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  28.31 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  27.61 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  29.83 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  29.09 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  27.41 
 
 		 339 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  27.44 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  29.7 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.7 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  28.38 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.94 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  28.94 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  28.94 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  29.7 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  23.44 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  29.7 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  29.7 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  29.7 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  28.66 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.52 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  25.07 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  25.57 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  26.6 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  26.6 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  26.6 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  28.23 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  28.75 
 
 		 338 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  29.37 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  26.26 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  26.26 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>