More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3268 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  94.35 
 
 		 336 aa  634    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  688    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  79.76 
 
 		 338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  77.68 
 
 		 337 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  73.13 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  72.54 
 
 		 337 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  71.64 
 
 		 337 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  72.24 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  71.94 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  72.24 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  71.64 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  71.64 
 
 		 337 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  69.64 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  62.91 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  62.61 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  64.09 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  61.01 
 
 		 337 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  62.61 
 
 		 341 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  62.31 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  56.42 
 
 		 334 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  54.17 
 
 		 335 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  51.04 
 
 		 336 aa  348  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  52.08 
 
 		 335 aa  338  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  43.92 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  48.36 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  42.73 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  43.32 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  40.12 
 
 		 337 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  39.52 
 
 		 337 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 		 343 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  39.83 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  38.25 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  38.3 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.94 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  29.88 
 
 		 339 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  30.82 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  29.67 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.66 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  29.82 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.01 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.41 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.92 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  30.03 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.03 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  30.03 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  30.03 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  30.03 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  30.03 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.23 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.37 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  30.3 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  30.77 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  29.72 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  30.42 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  26.62 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  26.62 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  26.62 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  26.62 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.71 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  29.29 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  29.34 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  26.3 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  26.3 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.41 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  29.03 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  28.57 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.87 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  28.92 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  26.65 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  27.49 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28.49 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.21 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.97 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  27.19 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  26.67 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  28.9 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  26.55 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>