More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1332 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  100 
 
 
347 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  89.97 
 
 
349 aa  617  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  80 
 
 
340 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  75.65 
 
 
345 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  75.07 
 
 
345 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  75.07 
 
 
345 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  75.07 
 
 
345 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  74.78 
 
 
345 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  74.78 
 
 
345 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  57.64 
 
 
342 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  51.9 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1451  oxidoreductase family protein  77.46 
 
 
580 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  43.55 
 
 
361 aa  297  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  45.19 
 
 
350 aa  294  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  42.49 
 
 
355 aa  290  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  41.81 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  41.24 
 
 
366 aa  280  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  40.94 
 
 
355 aa  272  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 
337 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.78 
 
 
350 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.78 
 
 
349 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  38.2 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  38.2 
 
 
366 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 
365 aa  223  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  36.02 
 
 
352 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  32.26 
 
 
336 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.55 
 
 
335 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  32.35 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.6 
 
 
337 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.94 
 
 
341 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.64 
 
 
341 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  33.94 
 
 
341 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  33.94 
 
 
341 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
334 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  33.33 
 
 
341 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  34.02 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  34.56 
 
 
316 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 
337 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  34.5 
 
 
331 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
334 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  34.72 
 
 
344 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  37.58 
 
 
326 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  29.94 
 
 
340 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
340 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.56 
 
 
335 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  36.31 
 
 
352 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  37.08 
 
 
328 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
338 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  30.9 
 
 
347 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.12 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  33.58 
 
 
287 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  32.65 
 
 
339 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.71 
 
 
329 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  34.39 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.06 
 
 
328 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  35.06 
 
 
328 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  35.06 
 
 
328 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.71 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  33.81 
 
 
339 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  35.86 
 
 
334 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  35.71 
 
 
328 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  35.53 
 
 
331 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  34.83 
 
 
330 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  35.39 
 
 
328 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  34.39 
 
 
339 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  33.52 
 
 
339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.52 
 
 
339 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  33.52 
 
 
339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  33.52 
 
 
339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  33.52 
 
 
339 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  33.52 
 
 
339 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  34.95 
 
 
323 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  31.66 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  32.65 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  32.47 
 
 
338 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  31.65 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  35.88 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  33.55 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  36.1 
 
 
333 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  33.96 
 
 
368 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
332 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  31.65 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  32.85 
 
 
339 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  34.87 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  35.57 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  32.73 
 
 
336 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 
339 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  33.55 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 
328 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  31.38 
 
 
340 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  33.14 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  32 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.69 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>