More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5817 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 355 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  75.07 
 
 		 372 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  68.12 
 
 		 352 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  65.71 
 
 		 353 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  57.35 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  50.45 
 
 		 367 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  45.43 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  47.18 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  48.22 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  45.56 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  46.43 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  45.86 
 
 		 350 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  44.97 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  45.74 
 
 		 353 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  46.13 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  44.08 
 
 		 352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  40.62 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  41.95 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  43.52 
 
 		 345 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  31.84 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  32.12 
 
 		 398 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  32.77 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  29.57 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.64 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.69 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.94 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.79 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.99 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.34 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.19 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.65 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 387 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.7 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 355 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30.12 
 
 		 345 aa  92.8  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  23.49 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  27.27 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.76 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.6 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.1 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.42 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.77 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 339 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  31.06 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 		 699 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.22 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  26.93 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  25.15 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>