More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0892 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
373 aa  736    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  59.5 
 
 
404 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  48.72 
 
 
371 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  49.57 
 
 
361 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  47.37 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  46.48 
 
 
355 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  46.93 
 
 
385 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  40.17 
 
 
366 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
383 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  33.92 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 
365 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  34.82 
 
 
357 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  34.2 
 
 
387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
344 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  40.6 
 
 
358 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  36.71 
 
 
349 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  35.63 
 
 
335 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  35.55 
 
 
391 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
364 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 
388 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  30.55 
 
 
365 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  34.1 
 
 
375 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
356 aa  136  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
359 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.41 
 
 
331 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
374 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
360 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
360 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
353 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 
388 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 
356 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 
342 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
356 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 
369 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.98 
 
 
370 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  35.29 
 
 
345 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.73 
 
 
339 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  29.12 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
337 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
364 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
339 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
359 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 
350 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
383 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  32.91 
 
 
390 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 
368 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
350 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  31.31 
 
 
349 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 
377 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.43 
 
 
353 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
350 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 
355 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.9 
 
 
363 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.47 
 
 
347 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.95 
 
 
366 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  35.19 
 
 
352 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
350 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  31.65 
 
 
335 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 
338 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
349 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 
389 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 
340 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
362 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.75 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  37.99 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  32.77 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 
351 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.63 
 
 
313 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  29.03 
 
 
351 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>