More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 335 aa  683    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  75.75 
 
 		 337 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  61.56 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  50.15 
 
 		 333 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  37.1 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  37.16 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.56 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.56 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.66 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  35.27 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  30.15 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  35.02 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  34.09 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.14 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  34.42 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 435 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 435 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 468 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  31.1 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.09 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  33.09 
 
 		 377 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 344 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  34.68 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.2 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  31.99 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.88 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 		 399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.63 
 
 		 388 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.57 
 
 		 438 aa  115  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.56 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.17 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.19 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  31.29 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.41 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.5 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.31 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.31 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.31 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.31 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  28 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  29.47 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  32.29 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>