More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1704 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  701    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  47.91 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  38.61 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.51 
 
 
428 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.51 
 
 
329 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 
362 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 
344 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 
353 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
341 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.85 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.48 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  37.06 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  36.45 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  31.9 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.73 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
347 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
321 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 
358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.51 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.69 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
367 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 
371 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 
338 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 
359 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 
359 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
339 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  36.41 
 
 
354 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 
342 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 
349 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
387 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 
359 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.79 
 
 
388 aa  106  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  35.87 
 
 
400 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
355 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 
357 aa  106  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 
377 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
382 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 
359 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  34.29 
 
 
328 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 
377 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 
338 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  37.41 
 
 
372 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 
387 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
360 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
360 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 
325 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
365 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
334 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  35.2 
 
 
360 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
330 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 
344 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 
349 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  33.59 
 
 
404 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  33.84 
 
 
390 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
356 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 
344 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  36.68 
 
 
374 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
355 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
355 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
364 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
395 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
395 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
359 aa  99.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.24 
 
 
310 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
335 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 
337 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 
404 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
333 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  33.49 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  35.35 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  33.49 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  33.49 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  33.49 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  33.49 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.15 
 
 
332 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>