More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3780 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 335 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  46.15 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1299  oxidoreductase domain-containing protein  44.21 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 355 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  28.29 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0344  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 358 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.6 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  27.57 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 428 aa  87  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 381 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.94 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.37 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.33 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.54 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  34.75 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  35.82 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  25.51 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  24.79 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  26.92 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  23.7 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  25.21 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  24.51 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  28.85 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  26.39 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>