More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2241 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
361 aa  738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  52.22 
 
 
357 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  51.84 
 
 
357 aa  344  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  48.6 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  45.75 
 
 
366 aa  306  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  46.58 
 
 
362 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  44.63 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  34.5 
 
 
433 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  34.54 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  31.29 
 
 
438 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
468 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 
435 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
435 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 
458 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 
432 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  29.26 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.17 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
384 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
384 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  28.61 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.76 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
385 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
372 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
336 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 
405 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 
330 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  25.71 
 
 
344 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  26.39 
 
 
334 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
335 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
405 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
332 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
399 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
325 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  33.97 
 
 
328 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
328 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
337 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
328 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  23.3 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.29 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.74 
 
 
342 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
344 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
381 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.49 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.3 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.3 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  25.94 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  32.06 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.62 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 
356 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  26.72 
 
 
326 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  26.48 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.61 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.49 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  25 
 
 
337 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
327 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
667 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  29.37 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.91 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  25.91 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  27.62 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  32.7 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  31.22 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  29.66 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>