More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6056 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 398 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  56.35 
 
 		 374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  54.57 
 
 		 344 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  51.64 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  46.75 
 
 		 375 aa  363  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  44.24 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  44.57 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  47.92 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  48.66 
 
 		 349 aa  299  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  40.46 
 
 		 468 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  44.38 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  39.43 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  40.27 
 
 		 369 aa  291  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  38.64 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  40.06 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  36.92 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  36.98 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 432 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  37.2 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  34.97 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  32.15 
 
 		 374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 361 aa  132  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.66 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.78 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.98 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  26.38 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.5 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  29.41 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  23.94 
 
 		 329 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 336 aa  99.8  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 667 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 345 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 351 aa  93.6  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  22.86 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  23.48 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  22.88 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  23.7 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  26.4 
 
 		 324 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 344 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  24.78 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  31.22 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  24.5 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  24.5 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  24.5 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  31.22 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  25.76 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  31.22 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  24.5 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.94 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  31.22 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>